En la década de 1940 se creó en la Universidad de Concepción el Club Deportivo Universitario, el cual competía en todas las ramas deportivas contra otros clubes de la época. Esta agrupación existió hasta la década de 1960.
En 1990, tras la elección de Augusto Parra como rector de la Universidad de Concepción, un grupo de personas de la comunidad universitaria y de la ciudad solicitó la refundación del Club Deportivo Universidad de Concepción. Se conformaron comisiones para llevar a cabo este proceso, estableciendo cuatro ramas principales: rugby, vóleibol, básquetbol y fútbol.